Производство гексана совершается путем его перегонки: начальная температура составляет 66° Цельсия, при перегонке половины требуемого объема она повышается до 67°, а на заключительном этапе составляет 69°. После завершения процесса перегонки полученный гексан заключают в металлические бочки объёмом 200 литров, что в весе равно 140 кг.
Поскольку гексан относится к алканам, большинство которых содержится в нефти и газе, его также добывают из этих природных ресурсов. Производство гексана требует специальных лабораторных условий, так как его пары при вдыхании и попадании на кожу оказывают негативное воздействие. Кроме того, допускается возможность угнетающего действия гексана на нервную систему, следствием чего является ослабление нижних конечностей.
Другим важным фактором, на который следует обращать особое внимание при производстве гексана, является его легковоспламеняемость. К быстрому возгоранию способно не только само вещество, но также и его пары, выделяемые при перегонке; следствием скопления паров может стать вспышка или взрыв. Очевидно, что качественный гексан производится только в определённых лабораториях, имеющих набор квалифицированных специалистов и соответствующую сертификацию.